Grubun lideri Muhammed Tokcan, Rus askerlerinin kuşatması altındaki 250 Çeçen savaşçıyı kurtarmak için bu eylemi yaptıklarını açıkladı. Düzceli ve Abhaz kökenli olduğu bildirilen Tokcan, kuşatma altındaki Çeçenlerin sağ olarak Çeçenistan’a dönmemeleri halinde gemiyi İstanbul Boğazı’nda havaya uçuracakları tehdidinde bulundu. Grubun lideri Tokcan, eyleme İstanbul’da son vermeleri konusunda güvenlik birimlerince ikna edildi. Bu arada Çeçen lider Cahar Dudayev ile de telefonla görüştürülen eylemcilerin bu kararında Dudayev’in, “Gerekli mesajı verdiniz, kan dökülmesini istemiyorum” sözlerinin de etkili olduğu bildirildi. 

Eylemciler 19 Ocak günü saat 12.00’de “Avrasya” feribotunu İstanbul Boğazı’nın Karadeniz çıkışına getirdiler. Burada güvenlik güçleriyle yaptıkları pazarlık sonunda saat 17.00’de aralarında Muhammed Tokcan’ın da bulunduğu 4 eylemci teslim oldu. Yolcuların arasına karışan ve gemide saklanan 5 eylemci ise güvenlik güçlerince yakalandı. Eylemcilerin teslim olmadan önce silahlarını ve üzerlerindeki bombaları denize attıkları anlaşıldı.

Avrasya Feribotu eylemcileri, Muhammed Emin Tokcan, Tuncer Özcan, Sedat Temiz, Erdinç Tekir, Ertan Coşkun, Ceyhan Molla Mehmetoğlu, Abhazya uyruklu Roki Gitsba ile Çeçenistan uyruklu Ramazan Zubareyev ve Viskhan Abdurrahmanov, 7 Mart 1997'de İstanbul 3 No’lu Devlet Güvenlik Mahkemesi tarafından, TCY'nin "gemi kaçırmak" fiilini düzenleyen  384. maddesine göre 5 yıl, "hürriyeti tahdit" suçuyla ilgili 179. maddesine göre de 3 yıl  10 ay 20 gün olmak üzere toplam 8 yıl 10 ay 20 gün ağır hapis cezasına çarptırıldı. 

Yargıtay 8. Ceza Dairesi, Avrasya Feribotu'nu kaçıran dokuz sanığın 8 yıl 10 ay 20 gün ağır hapis cezasına çarptırılmasına ilişkin hükmü 11 Temmuz 1997'de onadı.

Bu arada, dönemin Adalet Bakanı Şevket Kazan'ın 12 Şubat 1997'de, Avrasya Feribotu'nu kaçıran Muhammet Tokcan ve arkadaşlarının da tutuklu bulunduğu Kocaeli Ceza ve Tutukevi'ni ziyaret etmesi, kamuoyunda tartışmalara neden oldu.

Hükümlülerden Muhammed Tokcan, 6 Ekim 1997’de Dalaman Açık Tarım Cezaevi’nden, Çeçen Vishan Abdurrahmanov da 4 Ekim’de Bursa Devlet Hastanesi’nden kaçtılar. 21 Ekim 1997’de de öteki sanıklardan Ramazan Zubaroyev, Roki Gitsba ve Tuncer Özkan’ın firar ettikleri anlaşıldı.

Muhammet Emin Tokcan 29 Nisan 1999'da Atatürk Havalimanı'nda sahte kimlik ve pasaportla Rusya'nın Soçi kentine gitmek için uçağa binmeye teşebbüs ederken, görevlilerin durumu fark etmesi üzerine yakalandı.

Tokcan, 22 Aralık 2000 tarihinde yürürlüğe giren "Şartla Salıverilme Yasası"ndan yararlanarak cezaevinden çıktı.